Eduart Merkaj është emëruar në krye të Shërbimi i Kontrollit të Brendshëm të Burgjeve (SHKBB), institucion që me hyrjen në fuqi të ligjit të ri njihet si Agjencia e Mbikëqyrjes së Institucioneve të Ekzekutimit të Vendimeve Penale.
Merkaj më herët ka mbajtur detyrën e drejtorit të Agjencia e Mbikëqyrjes Policore (AMP).
Merkaj ka ushtruar funksione të ndryshme drejtuese në Policia e Shtetit.
