Shumica e njerëzve jashtë Afrikës mbajnë një deri në dy përqind ADN të Neandertalit, ndërsa popullatat aziatike dhe oqeanike përmbajnë gjithashtu afërsisht 0.1 deri në pesë përqind ADN Denisovane, me vlerat më të larta në Oqeani.
Të dy kontributet në gjenom tani konsiderohen të dokumentuara mirë sepse seksionet përkatëse mund të krahasohen me ADN-në fosile. Deri më tani janë publikuar gjashtë gjenome arkaike me rezolucion të lartë: katër nga Neandertalët dhe dy nga Denisovanët, të gjitha nga Euroazia. Për shumicën e specieve të tjera njerëzore të Pleistocenit, mungon një material i tillë krahasimi gjenetik, me të cilin mund të testohet një marrëdhënie.
Dy linja të panjohura
Një ekip i udhëhequr nga Priya Moorjani nga Universiteti i Kalifornisë, Berkeley, ka prezantuar tani një metodë që nuk mbështetet në referenca të lashta. Duke përdorur këtë metodë, studiuesit gjetën prova në gjenomet e njerëzve të gjallë për të paktën dy linja të tjera arkaike, për të cilat ende nuk janë gjetur mostra gjenetike. Njëra u kryqëzua me paraardhësit e Homo sapiens para përhapjes në shkallë të gjerë të specieve nga Afrika. Tjetra është aq e lashtë sa trashëgimia e saj mund të ketë hyrë në gjenomet moderne vetëm në mënyrë indirekte.
Ekipi zbuloi këto të dhëna duke përdorur një metodë të quajtur TRACE. Ajo rindërton të ashtuquajturit grafikë të rekombinimit stërgjyshor nga materiali gjenetik i njerëzve të sotëm – domethënë, pemët gjenealogjike të segmenteve individuale të ADN-së që ndryshojnë vazhdimisht përgjatë kromozomeve. Nëse një segment buron nga një popullatë që është ndarë herët, degët e tij do të takohen vetëm shumë më vonë në kohë.
Në të njëjtën kohë, segmentet e futura janë më të gjata se ato që rezultojnë nga renditja rastësore e varianteve më të vjetra. TRACE kërkon për të dy kriteret. “Gjenealogjitë ruajnë një regjistër të së kaluarës sonë evolucionare”, thotë Moorjani. Avantazhi i metodës është se nuk kërkon as një gjenom të sekuencuar të popullatës që kërkohet dhe as një grup kontrolli që garantohet se nuk ka marrë asnjë material gjenetik.
Prejardhja “fantazmë”
Duke zbatuar metodën e tyre në 503 gjenome nga Projekti 1000 Gjenome, studiuesit fillimisht zbuluan atë që dihej tashmë: 0.8 deri në 1 përqind prejardhje Neandertal për person tek evropianët, aziatikët lindorë dhe aziatikët jugorë, së bashku me sasi të vogla të prejardhjes Denisovane. Megjithatë, një pjesë e konsiderueshme e segmenteve të ADN-së së lashtë nuk përputhej me asnjërin prej dy gjenomeve. Këto segmente tregojnë pothuajse të njëjtën afërsi gjenetike me të dy linjat arkaike, duke sugjeruar një linjë të tretë, të pasekuencuar kurrë, që ishte po aq e lidhur ngushtë me të dyja.
Mesatarisht, 0.5 deri në 1.1 përqind e gjenomit për person i atribuohet kësaj linje “fantazmë”, si në popullatat afrikane ashtu edhe në ato jo-afrikane. Jo-afrikanët ndajnë shumicën e këtyre segmenteve me njerëz nga Afrika Sub-Sahariane, duke sugjeruar të paktën një ngjarje përzierjeje para përhapjes së tyre nga Afrika. “Ne ishim në gjendje të gjenim dhe të hartonim vendndodhjet në gjenomin e njerëzve të sotëm që burojnë nga kjo linjë fantazmë dhe të tregonim se kjo prejardhje është e pranishme tek të gjithë njerëzit e sotëm, jo vetëm tek afrikanët”, thotë Yulin Zhang, autori kryesor i studimit të botuar në revistën Science.
Koha e vlerësuar e bashkimit, domethënë pika në të cilën këto segmente dhe linjat moderne takohen në pemën gjenealogjike, është rreth 0.83 milion vjet më parë. Se kush ishte kjo popullatë mbetet një mister për momentin. Autorët sugjerojnë se kandidatët e mundshëm përfshijnë grupe nga Pleistoceni i Mesëm ose popullatat afrikane të lidhura me Homo heidelbergensis.
Lidhje familjare e lashtë
Është zbuluese se ku shfaqen këto segmente, domethënë edhe në rajonet e gjenomit që konsiderohen “shkretëtira” të Neandertalit dhe Denisovit dhe për këtë arsye interpretohen si specifike për Homo sapiens. Në një shkretëtirë të tillë në kromozomin 7, prejardhja e Neandertalit arrin në 13.3 përqind.
Sinjali i dytë u shfaq vetëm kur ekipi shqyrtoi 92 gjenome me rezolucion të lartë nga Oqeania, konkretisht nga Papua Guinea e Re, Vanuatu dhe Ishujt Santa Cruz. Brenda segmenteve Denisovan, ata zbuluan seksione gjenealogjitë e të cilave shtrihen edhe më tej. Ata vlerësojnë se koha e bashkimit të tyre me linjat moderne njerëzore është afërsisht 1.77 milion vjet më parë.
Studiuesit ofrojnë shpjegimin më të besueshëm duke sugjeruar që një linjë shumë e lashtë i kaloi materialin gjenetik denisovanëve dhe një pjesë e vogël e kësaj më vonë i kaloi Homo sapiens përmes tyre. Këto segmente superarkaike përbëjnë afërsisht 0.3 përqind të prejardhjes denisovane të identifikuar nga TRACE në Oqeani – një pjesë e një proporcioni tashmë të vogël dhe, sipas ekipit, një kufi i poshtëm shumë konservator.
Homo erectus si kandidat
“Zbulimi superarkaik është veçanërisht emocionues sepse zbulon kontribute gjenetike nga një prejardhje që jetoi mbi një milion vjet më parë, edhe pse nuk ekziston asnjë ADN e sekuencuar nga kjo popullatë”, thotë bashkautori Arjun Biddanda. Homo erectus do të ishte kronologjikisht në përputhje me një ndarje rreth 1.8 milion vjet më parë dhe përmendet në studim si një kandidat i mundshëm.
Disa pasiguri mbeten, siç e pranojnë edhe studiuesit: TRACE funksionon me shumë saktësi në simulime. Megjithatë, shkalla e goditjeve bie ndjeshëm kur përdoren gjenealogji të rindërtuara në vend të atyre të vërteta. Në vend të afërsisht 80 përqind të segmenteve të futura, metoda gjen vetëm gjysmën ose më pak, varësisht nga teknika. Prandaj, përmasat e deklaruara ka të ngjarë të nënvlerësohen. Sa ngjarje kryqëzimi kanë ndodhur, kur saktësisht dhe ku, për këtë arsye, mbetet pjesërisht e paqartë.
Të dy llojet e segmenteve janë të përqendruara dukshëm në rajonet e gjenomit që lidhen me funksionin imunitar dhe metabolizmin, por kjo nuk do të thotë domosdoshmërisht asgjë. “Ne shpesh e imagjinojmë evolucionin njerëzor si një pemë që degëzohet, por të dhënat e reja të gjenomit dhe metodat analitike tregojnë një histori shumë më të ndërthurur, më shumë një rrjet kompleks popullatash të lidhura nga migrime dhe kryqëzime të përsëritura”, thotë Moorjani.
Mbetet e paqartë saktësisht se cilat shtigje ndoqi linja super-arkaike. Nëse ajo hyri në gjenomet moderne ekskluzivisht nëpërmjet Denisovanëve apo rezultoi nga kontakti i drejtpërdrejtë me paraardhësit e Homo sapiens nuk mund të përcaktohet aktualisht. Megjithatë, gjenomet e referencës së mëtejshme të Denisovanëve mund ta sqarojnë këtë.
